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| Rossi,Robson Marcelo; Martins,Elias Nunes; Lopes,Paulo Sávio; Silva,Fabyano Fonseca e. |
| O objetivo deste trabalho foi apresentar modelagens alternativas, uni e bivariadas, para avaliação da conversão alimentar (CA) de suínos da raça Piau, com uso de inferência bayesiana. Os efeitos de sexo e genótipo sobre a CA dos animais foram avaliados por meio de procedimentos de simulação de Monte Carlo via cadeias de Markov (MCMC) e de integração aproximada aninhada de Laplace (INLA). O modelo univariado foi avaliado com diferentes distribuições para o erro - normal (gaussiana), t de Student, gama, log-normal e skew-normal -, enquanto, para o modelo bivariado, considerou-se o erro normal. A distribuição skew-normal foi o modelo mais parcimonioso para inferir sobre a resposta direta (univariada) da CA aos efeitos de sexo e genótipo, os quais não foram... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Análise multivariada; Desempenho nutricional; INLA; MCMC; Síndrome do estresse suíno.. |
| Ano: 2014 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2014001000754 |
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| Cobuci,Jaime Araujo; Euclydes,Ricardo Frederico; Costa,Claudio Napolis; Lopes,Paulo Sávio; Torres,Robledo de Ameida; Pereira,Carmen Silva. |
| Foram utilizados 87.045 registros de produção de leite, na primeira lactação, de 11.023 vacas da raça Holandesa, obtidos nos anos de 1997 a 2001, em diferentes rebanhos distribuídos em dez núcleos do Estado de Minas Gerais. Foram avaliados seis tipos de mensuração da persistência na lactação utilizando-se os valores genéticos da produção de leite, obtidos por meio do modelo de regressão aleatória - MRA. Utilizou-se a função de Wilmink na descrição dos efeitos aleatórios e fixos, pelo MRA. As estimativas de herdabilidade e de correlação genética, para as várias mensurações da persistência na lactação, variaram em decorrência da definição da persistência. As estimativas de herdabilidade para persistência na lactação variaram de 0,11 a 0,27 e as estimativas... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Correlação genética; Herdabilidade; Modelos de regressão aleatória; Persistência na lactação; Produção de leite no dia do controle; Raça Holandesa. |
| Ano: 2004 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982004000300004 |
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| Cobuci,Jaime Araujo; Euclydes,Ricardo Frederico; Teodoro,Roberto Luiz; Verneque,Rui da Silva; Lopes,Paulo Sávio; Silva,Martinho de Almeida e. |
| O conhecimento das relações genéticas entre os parâmetros da curva de lactação e a produção de leite é importante para a seleção de vacas e de touros. Os registros de produção de leite de 583 vacas da raça Guzerá, filhas de 165 reprodutores, foram usados para estimação dos parâmetros da curva de lactação em dois modelos matemáticos. As informações referentes às produções de leite foram obtidas usando-se a base de dados extraída do Arquivo Zootécnico Nacional, mantido na Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa Gado de Leite). As análises foram efetuadas usando-se o sistema MTDFREML, sob modelo animal que incluiu os efeitos fixos de rebanho-ano-estação de parto e, como covariável, a idade da vaca ao parto, com termos linear e quadrático. Como... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Correlações genéticas; Curva de lactação; Método REML; Modelos matemáticos; Raça Guzerá. |
| Ano: 2001 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982001000500011 |
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| Faria,Danielle Assis de; Guimarães,Simone Eliza Facioni; Lopes,Paulo Sávio; Pires,Aldrin Vieira; Paiva,Samuel Rezende; Sollero,Bruna Pena; Wenceslau,Amauri Arias. |
| The association between G316A growth hormone polymorphism and quantitative traits was investigated in an F2 population of pigs. Association analyses were performed using a statistical model that included genotype, sex, batch and sex by genotype interaction as fixed effects and sire as random effect. The polymorphism was associated with the number of right teats (p = 0.03), heart weight (p = 0.04), lung weight (p = 0.05), carcass length determined by the Brazilian carcass classification method (p = 0.04), picnic shoulder weight (p = 0.07), jowl weight (p = 0.01), pH 24 h after slaughtering (p = 0.03) and drip loss (p = 0.01). Interaction between genotype and sex was observed for six performance traits. The additive effect was significant (p < 0.10) for... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Candidate genes; Divergent cross; Molecular marker; Sex x genotype interaction; Swine. |
| Ano: 2006 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572006000400010 |
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| Faria,Danielle Assis de; Peixoto,Jane de Oliveira; Lopes,Paulo Sávio; Paiva,Samuel Rezende; Silva,Priscila Vendramini; Guimarães,Simone Eliza Facioni. |
| This study investigated the association between IGF-I microsatellite marker in an F2 population (N=459) generated by mating of native boars to Brazilian commercial sows with performance, carcass cut, and meat quality traits. Association analyses were carried out using a statistical model that included genotype, sex, and group as fixed effects and sire as random effect. The IGF-I genotypes were significantly associated with different quantitative traits and these results corroborate with previous QTL analyses obtained for this chromosome region in swine. Additive and dominance effects, as well as a genotype-sex interaction, were estimated and discussed in the text. According to the results obtained, this marker is suitable for QTL search in the genotyped... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Divergent cross; Microsatellite marker; Quantitative traits; Sex × genotype interaction; Swine. |
| Ano: 2009 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982009000200007 |
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| Peixoto,Jane de Oliveira; Faria,Danielle Assis de; Silva,Priscila Vendramini; Fonseca,Isabela; Lopes,Paulo Sávio; Guimarães,Simone Eliza Facioni. |
| It was investigated the association between leptin gene single nucleotide polymorphisms (SNPs) T2411C and T3266G with carcass traits in F2 pigs obtained by crossing native Brazilian Piau with commercial sows composed of Landrace, Large White and Pietrain breeds. Association analyses were performed using a statistical model that included genotype, sex, and batch as fixed effects, sire and error as random effects. The T2411C SNP was associated with skinless and fatless boston shoulder weight (BSW), backfat thickness at last rib, 6.5 cm from the midline (P2), skinless and fatless picnic shoulder weight, and sirloin weight (SLW). The T3266G mutation was associated with slaughter age, bacon weight, BSW, midline backfat thickness between last and last but one... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Candidate gene; Pig genomics; Pig production. |
| Ano: 2009 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982009000200008 |
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| Carmo,Fausto Moreira da Silva; Guimarães,Simone Eliza Facioni; Lopes,Paulo Sávio; Pires,Aldrin Vieira; Guimarães,Marta Fonseca Martins; Silva,Marcos Vinícius Gualberto Barbosa da; Schierholt,Alex Sandro; Silva,Kleibe de Moraes e; Gomide,Lúcio Alberto de Miranda. |
| We studied the phenotypic effects of polymorphisms at the MYF5 gene in a divergent F2 swine population and found that one polymorphism was due to an insertion and another to a deletion. The genotypes of 359 F2 animals were obtained and the Normal/Normal (NN) and Normal/Insertion (NI) genotypes analyzed to determine associations with phenotypic data for performance, carcass and meat quality traits. Significant differences were observed (p < 0.05) between NN and NI animals for drip (NN = 3.14 ± 1.56; NI = 3.69 ± 2.78%), cooking (NN = 32.26 ± 2.41; NI = 33.21 ± 2.31%) and total loss (NN = 34.16 ± 2.63 and NI = 34.97 ± 2.08%). The Deletion marker was not statistically tested. The results indicate that the allelic variant Insertion is associated with a... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Myogenesis; DNA sequencing; Pig production; PCR. |
| Ano: 2005 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572005000300004 |
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| Abreu,Urbano Gomes Pinto de; Lopes,Paulo Sávio; Torres,Robledo de Almeida; Santos,Heleno do Nascimento. |
| O desempenho produtivo de 1.075 matrizes e a estrutura etária do rebanho foram monitorados durante cinco anos (maio de 1994 a maio de 1999) em uma fazenda com sistema extensivo de cria de bovinos de corte na região do Pantanal. Nesse período, tecnologias foram introduzidas com o objetivo de modificar o sistema tradicional de produção da região e, conseqüentemente, melhorar o desempenho produtivo do rebanho de cria como um todo. As vacas foram numeradas e monitoradas durante a realização dos trabalhos de gado (TG), sendo classificadas como solteira ou parida e, conforme avaliação do desempenho reprodutivo ao longo dos trabalhos de gado, eram mantidas no rebanho ou descartadas. Os resultados foram modelados por meio de equações de estimação generalizadas... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Avaliação de rebanho; Sistema de produção extensiva; Equações de estimação generalizadas. |
| Ano: 2006 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982006000800040 |
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| Abreu,Urbano Gomes Pinto de; Lopes,Paulo Sávio; Baptista,Antonio José M. dos Santos; Torres,Robledo de Almeida; Santos,Heleno do Nascimento. |
| Utilizando-se a metodologia de análise envoltória de dados (DEA), analisou-se, neste estudo, a eficiência de um sistema de produção no qual foram implantadas tecnologias ao longo de oito anos (1995-2002). Foram consideradas informações sobre dez categorias de gastos com insumos (inputs) e uma categoria de produto (output). Utilizou-se a técnica multivariada de componentes principais, com o objetivo de diminuir o número das variáveis de input. Os insumos sal mineral/vacinas/medicamentos, mão-de-obra/encargos sociais e investimentos apresentaram correlação significativa com os três primeiros componentes principais, que explicaram 91,6% da variância total. As eficiências verificadas nos anos de 1995, 1996, 1997, 1998, 1999, 2000, 2001 e 2002, respectivamente,... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Análise envoltória de dados (DEA); Bovino de corte; Sistema de produção. |
| Ano: 2006 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982006000400040 |
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| Barbosa,Leandro; Lopes,Paulo Sávio; Regazzi,Adair José; Guimarães,Simone Eliza Facioni; Torres,Robledo de Almeida. |
| Dados de 367 animais de uma população F2 de suínos foram utilizados na análise estatística, utilizando-se os componentes principais, para avaliação da possibilidade de redução da dimensionalidade do espaço multivariado em 33 características de carcaça. Dos 33 componentes principais, 17 apresentaram variância inferior a 0,7 (autovalor inferior a 0,7), que sugere 17 variáveis para descarte e correlação linear simples significativa com as demais, ou seja, foram redundantes. Com base nos resultados, recomenda-se que as seguintes variáveis sejam mantidas em experimentos futuros: idade ao abate; peso da meia-carcaça direita; comprimento da carcaça pelo Método Brasileiro de Classificação de Carcaça; maior espessura de toucinho na região da copa, na linha... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Análise multivariada; Carcaça; Correlação; Descarte de variáveis. |
| Ano: 2005 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982005000700007 |
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| Barbosa,Leandro; Lopes,Paulo Sávio; Regazzi,Adair José; Guimarães,Simone Eliza Facioni; Torres,Robledo de Almeida. |
| Dados de 326 animais de uma população F2 de suínos foram utilizados para avaliar a redução da dimensionalidade do espaço multivariado por meio de componentes principais. Foram consideradas as seguintes características: pH aos 45 minutos e 24 horas post-mortem (pH45 e pHu, respectivamente), perda de peso por gotejamento (GOTEJ), perda de peso por cozimento (COZ), perda de peso total (PTOT), gordura intramuscular (GORINT), maciez objetiva (MACIEZ), luminosidade (L), índice de vermelho (a) e índice de amarelo (b). Quatro componentes principais, obtidos a partir da matriz de correlação, apresentaram variância inferior a 0,7 (autovalor inferior a 0,7), o que sugere quatro variáveis para descarte, por apresentarem maiores coeficientes, em valor absoluto, a... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Análise multivariada; Correlação; Descarte de variáveis; Suínos. |
| Ano: 2006 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982006000600009 |
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| Carneiro Júnior,José Marques; Euclydes,Ricardo Frederico; Lopes,Paulo Sávio; Torres,Robledo de Almeida. |
| Estudos de simulação foram conduzidos com o objetivo de realizar análise comparativa entre os métodos de estimação de componentes de variância: método da máxima verossimilhança restrita (REML), método da máxima verossimilhança (ML) e método III de Henderson. Todos os três métodos foram utilizados com modelo reprodutor, e o método REML foi utilizado também com modelo animal. Objetivou-se verificar, principalmente, o efeito do desbalanceamento na estimação dos componentes de variância. Foi simulado um genoma, constituído de uma única característica quantitativa governada por 200 locos. O genoma foi utilizado na construção de três populações-base com herdabilidades de 0,60, 0,30 e 0,10, constituídas de 1000 animais (500 machos e 500 fêmeas). A partir de cada... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Componentes de variância; Estimação/métodos; Melhoramento animal; Simulação. |
| Ano: 2004 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982004000200008 |
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| Torres Filho,Rodolpho de Almeida; Torres,Robledo de Almeida; Lopes,Paulo Sávio; Euclydes,Ricardo Frederico; Araújo,Cláudio Vieira de; Pereira,Carmen Silva; Silva,Martinho de Almeida e. |
| Foram analisados dados de características de desempenho e reprodutivas de suínos de uma linha em desenvolvimento da raça Large White, para verificar a importância da inclusão dos efeitos materno e comum de leitegada nos modelos de avaliação genética animal, utilizando quatro diferentes modelos: modelo 1 - efeito genético aditivo direto; modelo 2 - efeito genético aditivo direto e materno; modelo 3 - efeito genético aditivo direto e comum de leitegada; e modelo 4 - efeito genético aditivo direto e materno e comum de leitegada. As características foram avaliadas pelo método da máxima verossimilhança restrita (REML), obtendo um valor de verossimilhança para cada característica. O teste da razão de verossimilhança foi aplicado para verificar qual o modelo mais... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Correlação amostral; Correlação de ordem; Efeito materno; Efeito comum de leitegada; Teste da razão de verossimilhança. |
| Ano: 2004 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982004000200011 |
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| Pires,Aldrin Vieira; Lopes,Paulo Sávio; Torres,Robledo de Almeida; Euclydes,Ricardo Frederico; Regazzi,Adair José; Costa,André Ribeiro Corrêa da. |
| Foram analisados dados de características reprodutivas de três raças de suínos, Duroc, Landrace e Large White, para avaliar a importância de inclusão dos efeitos genético materno e comum de leitegada em modelos animais. As características tamanho de leitegada ao nascimento, tamanho de leitegada ao desmame, peso de leitegada ao nascimento, peso de leitegada aos 21 dias de idade e taxa de mortalidade foram avaliadas pelo método da máxima verossimilhança restrita (REML), obtendo-se um valor de verossimilhança para cada característica e raça. O teste da razão de verossimilhança foi aplicado para se verificar qual o modelo mais adequado na avaliação genética animal: o modelo 1, que continha o efeito genético direto; o modelo 2, que continha os efeitos genéticos... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Efeito materno; Modelo animal; REML; Teste da razão de verossimilhança. |
| Ano: 2000 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982000000600013 |
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| Sakaguti,Eduardo Shiguero; Silva,Martinho de Almeida e; Quaas,Richard Louis; Martins,Elias Nunes; Lopes,Paulo Sávio; Silva,Luiz Otávio Campos da. |
| As estimativas de máxima verossimilhança restrita (REML), das variâncias e das covariâncias genéticas aditivas e residuais, do peso ao nascimento e dos pesos ajustados aos 120, 205, 240, 365, 420 e 550 dias de idade foram empregadas para determinar funções de covariâncias (CFs) do crescimento de 41.415 bovinos da raça Tabapuã, nascidos entre 1975 e 1997 e criados em regime de pastagem. A estimação das CFs mostrou-se bastante útil, pois, além de avaliar covariâncias entre qualquer par de idades, a análise das autofunções, associada aos autovalores das matrizes de coeficientes das CFs, revelou que as curvas de crescimento dos animais podem ser rapidamente alteradas pela seleção. Fatores como o estresse provocado pelo desmame, o ganho compensatório e a... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Crescimento de bovinos; Funções de covariância; Parâmetros genéticos; Polinômios de Legendre. |
| Ano: 2003 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982003000400011 |
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| Ferreira,William José; Teixeira,Nilson Milagres; Euclydes,Ricardo Frederico; Verneque,Rui da Silva; Lopes,Paulo Sávio; Torres,Robledo de Almeida; Wenceslau,Amauri Arias; Silva,Marcos Vinícius Gualberto Barbosa da; Magalhães Júnior,Márcio Nery. |
| Utilizaram-se 153.963 controles mensais de produção de leite e 13.273 primeiras lactações de vacas da raça Holandesa, com partos entre 1989 a 1998, com o objetivo de estimar parâmetros genéticos, fenotípicos e de meio ambiente para produção de leite no dia do controle (PLDC) e produção até 305 dias de lactação (P305), bem como verificar a conveniência de se utilizar a PLDC em avaliações genéticas, em substituição à P305. Foram utilizados quatro modelos (modelo animal). Em dois, modelos 1 e 2, consideraram-se os controles mensais de produção, coletados ao longo da lactação, como medidas repetidas de um animal, diferenciados segundo o critério de formação de grupos de animais contemporâneos. No modelo 1 (PLDCM01), as produções dos animais foram agrupadas... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Controle mensal; Método REML; Modelo animal; Produção de leite; Raça Holandesa. |
| Ano: 2003 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982003000200007 |
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| Sarmento,José Lindenberg Rocha; Reis Filho,João Cruz; Albuquerque,Lucia Galvão de; Lopes,Paulo Sávio; Rodrigues,Marcelo Teixeira. |
| Com os objetivos de estimar os parâmetros genéticos e predizer os valores genéticos para produção de leite no dia do controle (PLDC) e para produção acumulada (PAC), utilizaram-se dados de 356 cabras da raça Alpina, com 825 lactações e 26.389 controles semanais efetuados entre os anos de 1997 e 2004. A PLDC foi analisada considerando-se o efeito fixo de grupo contemporâneo (ano-mês de controle), a idade da cabra ao parto, como covariável, e os efeitos aleatórios genético aditivo e de ambiente permanente. Para PAC, o modelo incluiu os mesmos efeitos aleatórios, o efeito fixo de grupo contemporâneo (ano-mês de parto) e as covariáveis idade da cabra ao parto e duração da lactação. Em geral, as herdabilidades estimadas foram de maiores magnitudes na primeira... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Caprinos leiteiros; Componentes de variância; Modelo animal; Parâmetros genéticos; Seleção. |
| Ano: 2006 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982006000200015 |
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| Abreu,Urbano Gomes Pinto de; Gomes,Eliane Gonçalves; Lopes,Paulo Sávio; Torres,Robledo de Almeida; Santos,Heleno do Nascimento. |
| Este trabalho foi realizado com o objetivo de avaliar, por meio de diferentes modelos de Análise Envoltória de Dados (DEA), a eficiência da introdução e adaptação de tecnologias no sistema de produção de cria extensiva do Pantanal. Utilizaram-se dados econômicos registrados durante oito anos (1995 a 2002). Duas metodologias de escolha das variáveis foram utilizadas para a realização da análise DEA: a primeira é uma variante do método multicritério de seleção de variáveis, que combina os objetivos conflitantes de melhor ordenação das unidades de decisão e maior eficiência média, e a segunda inclui técnicas de estatística multivariada. Nos dois modelos resultantes (com seis inputs e um output; e com três inputs e um output, respectivamente), foram analisados... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Avaliação de desempenho; Eficiência; Sistema de produção. |
| Ano: 2008 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982008001100025 |
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| Cunha,Elizângela Emídio; Euclydes,Ricardo Frederico; Lopes,Paulo Sávio; Torres,Robledo de Almeida; Carneiro,Paulo Luiz Souza. |
| The aim of this work was to investigate the short-term behavior of the genetic variability of quantitative traits simulated from models with additive and non-additive gene action in control and phenotypic selection populations. Both traits, one with low (h² = 0.10) and the other with high (h² = 0.60) heritability, were controlled by 600 biallelic loci. From a standard genome, it was obtained six genetic models which included the following: only the additive gene effects; complete and positive dominance for 25, 50, 75 and 100% of the loci; and positive overdominance for 50% of the loci. In the models with dominance deviation, the additive allelic effects were also included for 100% of the loci. Genetic variability was quantified from generation to... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Closed population; Computer simulation; Dominance deviation; Genetic variability; Intralocus interaction. |
| Ano: 2010 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982010000900013 |
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| Braccini Neto,José; Silva,Martinho de Almeida e; Euclydes,Ricardo Frederico; Lopes,Paulo Sávio; Torres,Robledo de Almeida; Regazzi,Adair José. |
| Foram simuladas, utilizando o programa GENESYS, sete populações com diferentes médias genéticas e estruturas de dados resultantes da substituição de 0, 10, 25, 50, 75, 90 e 100% de reprodutores, com o objetivo de comparar a metodologia de modelos mistos (MMM) com a metodologia GenSys, por meio de suas acurácias e variâncias do erro de predição (PEV), estimadas com base no modelo de reprodutor e no modelo animal. No modelo de reprodutor, à medida que se aumentava a intensidade de seleção, ocorriam diminuição na acurácia e aumento da PEV de ambas as metodologias, em razão da menor acurácia na estimação dos níveis do efeito fixo e da diminuição do número médio de progênies/reprodutor. A superioridade da MMM no modelo de reprodutor foi atribuída à maior... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: GenSys; Modelo animal; Modelo de reprodutor; Modelos mistos. |
| Ano: 2004 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982004000700006 |
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